藥物活性成分和靶點篩選

中藥主要活性成分研究

1.1利用UHPLC-QTOF-MS分析中藥的主要活性物質(zhì)

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圖1樣品UHPLC-QTOF-MS檢測正離子模式TIC圖

 

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圖2樣品UHPLC-QTOF-MS檢測負離子模式TIC圖

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圖3  樣品主要組成

1.2 利用中藥研究數(shù)據(jù)庫研究中藥主要活性成分

利用中藥研究數(shù)據(jù)庫，根據(jù)中藥的ADME參數(shù)，找出有藥用開發(fā)價值的活性成分。

Mol ID

Molecule Name

MW

OB (%)

Caco-2

DL

Compound structure

MOL002467

6-gingerol

294.43

35.64

0.54

0.16

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MOL002495

6-shogaol

276.41

31

1.07

0.14

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MOL000131

EIC

280.5

41.9

1.16

0.14

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MOL000432

linolenic acid

278.48

45.01

1.21

0.15

1560320014655087.png

MOL000449

Stigmasterol

412.77

43.83

1.44

0.76

1560320059876538.png

MOL000676

DBP

278.38

64.54

0.8

0.13

1560320101845325.png

MOL001945

Majudin

216.2

42.21

0.94

0.13

1560320146447552.png

MOL003358

Euxanthone

228.21

92.98

0.68

0.16

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MOL008698

Dihydrocapsaicin

307.48

47.07

0.98

0.19

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表1 樣品活性成份篩選

活性成份靶點分析

利用中藥研究數(shù)據(jù)庫，研究活性成分對應的人體生物靶標。

Uniprot

Gene symbol

Protein names

P35354

PTGS2

prostaglandin-endoperoxide synthase 2

P23975

SLC6A2

solute carrier family 6 member 2

Q01959

SLC6A3

solute carrier family 6 member 3

P16389

KCNA2

potassium voltage-gated channel subfamily A member 2

P23219

PTGS1

prostaglandin-endoperoxide synthase 1

P08235

NR3C2

nuclear receptor subfamily 3 group C member 2

P08913

ADRA2A

adrenoceptor alpha 2A

P36544

CHRNA7

cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit

Q14524

SCN5A

sodium voltage-gated channel alpha subunit 5

P17538

CTRB1

chymotrypsinogen B1

P27338

MAOB

monoamine oxidase B

P28223

HTR2A

5-hydroxytryptamine receptor 2A

表2 樣品活性成份靶點篩選

化合物-靶點網(wǎng)絡圖

利用生物信息學技術手段分析活性成分與蛋白靶點之間的互作網(wǎng)絡。

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圖4活性成分與蛋白靶點之間的互作網(wǎng)絡圖